さくらサイエンスプログラムで来日し、交流計画に参加した方は、修了時にさくらサイエンスプログラムの同窓会組織である、「さくらサイエンスクラブ」のメンバーとして認定されます。
「さくらサイエンスクラブ」では、クラブメンバーが継続的に日本と母国の架け橋となり、活躍していただくために役立つ情報をウェブサイトで提供したり、また、各地で同窓会を実施しています。また、メンバー同士もSNSでつながって、自由に交流しています。クラブの会員数は約40,000人となり、大きなネットワークになっています。
（さくらサイエンスクラブのウェブサイトはこちら です。）
これまでに行われた同窓会などの集まりの一覧はこちら です。同窓会ではプログラム参加時に交流した友人や受入れ機関の方と再会したり、新たな交流がスタートしたり、毎回、大いに盛り上がっています。
